《灼眼的夏娜》TV第二季的故事将从小说第八卷开始讲起,以NDS游戏《灼眼的夏娜DS》中的登场人物,红世之徒,戏睡乡“メア”入侵御崎市开始开篇。据监督渡部高志所说,故事会对第一季的一些伏笔作出解释,并加入不少这个时代的小故事。
适值此时,南太平洋海域传来发现宝藏的消息,哆啦A梦经不住大雄的软磨硬泡,同意展开这次寻宝大冒险。小伙伴们相继聚到一起,将目标锁定在加勒比海域一个名叫多摩斯的小岛上。他们的旅程原本充满乐趣,但是意外很快便发生。小伙伴们遭遇时空错乱,阴差阳错来到了17世纪。大雄被浪头冲走,下落不明。哆啦A梦等人被一艘海盗船救下,却弄丢了一次元空间袋。 海盗船船长吉德正准备前往金银岛寻找失踪的哥哥和侄子。哆啦A梦他们随船前往,殊不知更大的冒险即将到来……