その道中、一行は正体不明のポケモン「プニちゃん」を旅に連れていくのだが、「プニちゃん」は謎の集団・フレア団に狙われていた。 击败了第七道馆的道馆训练家葛吉花后,小智一行人继续以收集齐八枚徽章为目标向映雪市进发。在旅途中,他们遇到了正体不明的绿色生物“小软”(基格尔德·核心)及为其目标而行动的神秘团体“闪焰队”。
一切都源于被国家指控制造难民杀戮的前第78联合部队指挥官曾沃在(也由泽木宇配音)及其下属坚信这一切是国家阴谋。我曾经不愿意被污染,所以我试图通过互联网揭露大国的不法行为。在调查过程中,铃木逐渐了解到了真相,她也朝着组建自己的部队迈出了重要一步。。。这部电影是《攻壳机动队》前传《ARISE》的第二部。