《机动战士高达 THE ORIGIN》系列的第6作。继续讲述了因父亡故而变成孤儿的卡斯巴尔与阿尔黛西亚,在动荡大时代的洪流之中,面临的又一场人生巨变……标题中的“赤色彗星”便是夏亚·阿兹纳布尔的称号。故事发生在一个名叫赫沙雷姆兹·罗斯的虚构城市。时间和空间的扭曲将不同的世界与人类世界联系在一起。因此,生活在不同世界的古代种族的“血亲”来了,对人类安全构成了巨大威胁。为了维护世界和平,一个名为“秘密社会Lebra”的秘密组织在黑暗中活动。