毕业后的春歌进入了Shining事务所，接受事务所安排的“精修课程”新人训练。由七名美少年组成的乐队ST☆RISH，也在这家事务所进行训练。精修课程第一天，春歌重遇了一十木音也（寺岛拓笃 配音）以及圣川真斗（铃村健一 配音）他们，大家住在同一所新人宿舍，新生活即将开始。立志成为作曲家的春歌，会与他们擦出怎样的火花？在后来被称为传说中的出道Live中，ST☆RISH会有什么样的表现？这样一群炫彩夺目的青春偶像，朝着梦想，开始前进。
在危急的情况下，特勤局NERV的葛成美救出了真嗣，并在西本的指挥下将他带到了NERV的总部。但迎接真嗣的是他父亲的冷酷命令：驾驶一个名为“EVA”的巨大人形机器人与使徒作战。Shinji已经表示拒绝，在看到严重受伤的替补司机Ayumi后，他决定遵守父亲的命令。就这样，从未接受过作战训练的真嗣准备驾驶长荣第一架飞机对抗使徒。不断攻击的使徒、身份不明的Ayanami、来自德国的司机Soeru Mingrika Langley和14岁的男孩面临着远远超出他们自身能力的挑战。秀吉平静地观察着一切，一个名为“人类完成计划”的神秘计划正在按照他的计划实施。
