2008年に放送されたSFアニメ「マクロスF」の劇場版2部作の後編。2009年にロングランヒットを記録した前編「劇場版マクロスF イツワリノウタヒメ」に続き、新天地を目指して宇宙を旅する移民船団「マクロス・フロンティア」を舞台に、ナゾの生命体バジュラとの戦いに身を投じる少年アルトと歌姫シェリル、シェリルにあこがれる少女ランカが織りなすドラマを描く。前編と同じ、テレビ版の総監督を手がけた河森正治が監督を務める。
从那时起，五年过去了。亚马逊几乎被驱逐，世界正在走向和平。然而，感染亚马逊细胞的普通人的亚马逊化现象继续扩大，政府成立了一个新的4C组织，秘密驱逐亚马逊化的人类。其中，童年时被亚马逊抚养长大并变身为假面骑士的年轻人亚马逊·尼奥对抗亚马逊。
虽然生活中充满了许多不幸，但雪子是在亲人无微不至的照顾下长大的，所以她的性格非常乐观开朗，对未来也充满了期待。在一次意外事件中，雪子在街上遇到了一个名叫黑川森（杉野义郎饰演）的年轻歹徒，并无意中对他使用了“致命一击”。没想到，这一脚不仅没有惹恼森喜朗，反而唤醒了森喜朗心中一种不一样的情绪。森喜朗被这个善良坚强的女孩深深打动，决定扮演她的保护者。
