一个13岁的女孩在一栋楼的底部醒来,她叫Reggie Gardner(レイチェょガドナー), 没有记忆,也不知道她为什么会在这里。为了回到地面,她开始试图逃跑,但突然出现在她面前,一个脸上裹着绷带、手持镰刀的杀手,就像死神一样。
与此同时,石川学会会长伊田秀吉(一川春树饰演)高调参政,暗中向包括小泽在内的一批年轻政客发出信号,策划恐怖袭击,以此为契机点燃王朝变革的革命浪潮。绪方希望井上参与,但被对方拒绝,因此井上成为了伊达走向王位的绊脚石。。。这部电影是同名电视剧(另一部是《革命》)的电影版,并在2011年获得第34届日本电影学院奖主题奖。
为了报答自己的罪过,挽回失去的一切,兄弟俩踏上了寻找传说中的“哲人石”的旅程。几年后,一位右臂和左腿都被“机械盔甲”取代的国家炼金术士出现在人们面前。他被称为“钢铁的炼金术”。