单纯善良的宫田把痛苦无家可归的真纪领回了家暂住。对真纪有了好感,想进一步发展下去。不料,分手半年的前女友阿美(板谷由夏 饰)却突然出现。侦探神田和阿美进行了一项秘密交易,牵扯上了黑社会老大浅井(山下规介 饰)一笔丢失的巨款,这笔巨款和几个人都牵扯上了关系。真相慢慢浮上水面,5个人的命运和嘴脸在一夜之间无处遁形。
而到了海底,胖虎和小夫却想总想着去幽灵船寻宝,结果遇到了危险,大家也意外发现海底居然也居住着人类。进而发现亚特兰提斯和姆联邦这两个国家争相进行军备竞赛,得知亚特兰提斯预备发射鬼角弹的事,如果亚特兰提斯发射鬼角弹,那么全世界都会毁灭,因此为了阻止鬼角弹发射,大雄他们决定去亚特兰提斯的百慕大海域阻止这个阴谋。勇敢的少年们能拯救地球吗? 本片是哆啦A梦剧场版系列的第四部。