故事从山王联盟开始。在眼镜蛇首领的带领下,大和、阿丹、阿提等个性鲜明的成员聚集在山王联盟。他们脑子里唯一的想法就是保护这个社区。在他们几个维护社区和平并试图避免不必要冲突的人面前,出现了一名男子。作品描述身为班长(委员长)、并且拥有完美主义的主角「北神未海」,虽然暗恋着问题三人组之一的「东条潮」,却因为不断有人搅乱导致她至今无法告白。未海因为自己的事情搞的手忙脚乱,另一方面还要帮助其他人解决烦恼、并给他们完美的建议,《極上!!めちゃモテ委員長》就是描绘这些发生在主角周围大小事的高中校园作品。