《偶像大师》的诸位偶像少女，在漫画中成为了2头身的奇妙生物“小偶像”（ぷちどる），作品讲述的就是这些2头身生物围绕吃喝等主题的日常风格漫画。
这一次，他们有了一个统一的目标——暗杀他们的班主任，杀死他们的老师（福山润配音）。杀死老师是一种神奇的存在。它的外表不是人类的，但它有极其敏感的神经和快速的反应。没有人知道它来自哪里，也没有人知道为什么它会成为E班三年的家庭教师。由于想要摧毁地球，杀害一名教师已成为暗杀名单上的高价奖励。作为E班三年的学生，只要你成功地消除了杀害老师的行为，你就可以毕业。于是，在这位神秘的老师的簇拥下，充满危险的日常生活展开了。
次日武藏和城太郎（樱井将纪 饰）、熊五郎（田中春男 饰）旅行来至乡下，师徒三人一面锄地耕作，一面教习农民武艺，抵抗土匪。 这期间阿通（八千草薰 饰）和朱实（冈田茉莉子 饰）先后来此寻找武藏，朱实更在匪乱中不幸丧命。一年后，小次郎成为细川家臣，岩流岛将成为他和武藏的命运转折点……
