正在上小学三年级的樱桃小丸子(Tarako 配音),因班长丸尾末夫(飞田展男 配音)提出了抽签换座位的要求,抽到了她不喜欢的调皮同学大野健一(山口胜平 配音)跟彬山聪(真山亚子 配音)同桌。而且和最好的同学小玉(渡辺菜生子 配音)分了桌。这部电影改编自武士彦达的同名推理小说,主题是昭和时代最大的未解决事件。该片告诉了记者英诗·阿库津(由小林隆饰演)与青少年时期与这起事件有关的男子曾俊雅(耿野贞饰)之间的关系。