日本昭和46年6月的一个早晨，东京蒲田发生了一起凶杀案。受害者是一名60岁的男子，头部被钝器砸伤致死，但凶手制造了一种被火车压死的假象。据受害者到访的罗恩酒吧的女服务员说，受害者带着一个操着浓重东北口音的年轻人来到这里。
之后，小五郎被捕。柯南发现安室多出现在爆炸现场并受伤。为了回报毛利叔叔的清白，柯南、阿里博士和少年侦探队的年轻同伴们组队调查现场并收集证据。随着调查的深入，柯南发现这起爆炸案隐藏了包括恐怖分子和公共安全在内的多方之间的复杂关系，真相更让所有人震惊。。。这部电影是“名侦探柯南系列”的第22部动画剧场版，总票房收入超过90亿日元。
