12年前，发生在林加德王国的事件，留下了一个巨大的谜团，正在从人们的记忆中被遗忘。随着时间的推移，主人公薇和莉娜的两个姐妹在阿纳斯蒂亚王国过着稳定的日常生活。一天，一架巨大的飞机袭击了阿纳斯塔西娅。以这一天为分界线，女孩们的命运被卷入了漩涡。
就快放暑假了，小学生上原康一在放学回家的路上捡到一块大石头。他把石头带回了家，没想到用水一洗，里面竟跳出一只小河童来。小河童对他“咕”的叫了一声，于是康一就给它取名为“小咕”。 小咕会说人类的语言，几百年来他一直被埋在在地下。
一方面：格拉伯死后，斯巴达克斯和他的部下，如克雷斯、加尼克斯和埃贡领导的奴隶起义，在前往罗马的路上取得了连续的胜利。大多数在解放后获得自由的奴隶加入了这支军队，这加强了整个奴隶起义的力量。它一步一步地威胁着罗马的统治。
