数年后，在人类与“柱”持续战斗的天空中，身披战翼的女武神们以及支援者女武神的男人们，为了拯救世界而拼上性命翱翔天际。日本也不例外，与耸立于灵峰富士的巨大柱对峙的3名女武神。她们每个人都具备强劲的能力，但却都是些问题儿童。此时，一位王牌飞行员因某些缘由从欧洲前来…… “来吧，是反击的时候了，人类。终将来临的决战之日——诸神的黄昏已近在眼前。”
该剧改编自美国记者杰克·阿德尔斯坦的同名纪录片，记录了东京都警察局管辖范围内各种事件的第一手信息。故事发生在20世纪90年代末，杰克·阿德尔斯坦（安塞尔·阿尔戈特饰演）每天都进入东京霓虹灯的黑暗世界，那里的一切都不是表面上看起来的那样。
21世纪。人类终于实现了与其他智慧生物的接触。但这次相遇并不是一件幸福的事情。从黑社会入侵的怪物使大多数现代武器失效，人类的命运就像风中的蜡烛。但在同样饱受黑社会之苦的精灵环境条约机构的帮助下，人类实现了复活游戏。这就是那个神奇的女孩。
