故事开始于詹图骑着摩托车在高速公路上，接到了美空和沙玉姐姐的电话。万章去拜祭项城（女友）的墓，一海去拜祭三羽渡鸦的墓，环德睡着了。三都总督的演讲开始了，詹图从Smash手中救出了一对兄弟姐妹。由于伊能贤武的洗脑，人们袭击了战兔。
有一天，一个叫Yuzaki Guanting的女孩和父母搬到了春日部市，成为了这座城市的新成员。然而，从那天起，每个人再也没有做过一个美丽的梦。曾经温暖的梦境世界现在充满了痛苦、悲伤和恐惧，梦中的灾难正在逐渐延续到现实中。这一切的发生显然与宇崎密切相关。为了澄清事件真相，小新（Yashima Keiko配音）与冯健（森根赛配音）和妮妮（林玉旭配音）等朋友联手进行调查。
电视动画版的《攻壳机动队》分为两季。第一季描述：2030年，经历了四次世界大战的世界面临着更加严峻的挑战。随着人性化等技术的不断发展，犯罪行为变得越来越离奇和复杂。
