柏木空(田村睦心 配音)是一名平凡的男子高中生,因为父亲是一位冒险家,常常不在家,因此,从很小的时候起柏木空就开始独立生活,变得非常擅长料理家事。周围自然是女性,女孩们也对这个“世界上唯一能使用IS的男性”感兴趣,这导致了很多有趣的学校生活。某日,一群使用风遁之术的空忍空袭火之国,无数民众和忍者遇害,形势危急。据纲手大人所言,这群不速之客正是在第二次忍者大战中落败的空之团,如今他们怀着复仇之心再次出现。