单纯善良的宫田把痛苦无家可归的真纪领回了家暂住。对真纪有了好感,想进一步发展下去。不料,分手半年的前女友阿美(板谷由夏 饰)却突然出现。侦探神田和阿美进行了一项秘密交易,牵扯上了黑社会老大浅井(山下规介 饰)一笔丢失的巨款,这笔巨款和几个人都牵扯上了关系。真相慢慢浮上水面,5个人的命运和嘴脸在一夜之间无处遁形。
故事发生在遥远的26世纪。外科医生伊德(克里斯托弗·沃尔茨克里斯托弗·沃尔兹饰)抱起一个只剩下头的机械女孩,把她带回家。她安装了最初为她死去的女儿准备的尸体,取名为Alita(罗莎·萨拉扎尔饰)。
在复兴的同时,为了防卫而进行的包含最新锐战舰安德洛墨达在内的新锐舰队的整备工作也在推进中。 伊斯坎达尔的丝塔夏的愿望也化为乌有,地球开始迈向扩军之道。 这真的是在无可替代的多数牺牲之后,大和所达成的真正的和平吗? 期盼宇宙平稳的女神特蕾莎的祈愿,将大和邀往新的航海。 如今,席卷宇宙的加特兰蒂斯的威胁,正在逼近地球——。