特別編集版は、TVアニメシリーズ全12話＋新カット・新アフレコで再構成されており、アルマとナイトの戦いを中心に、ナイトから見た研美との戦いを描く。天保二年冬天，运金船在越前鲭江藩海上遇难，附近黑崎村村民拾得金银，但不久后全村人离奇消失。 三年后浪人胁坂孙兵卫（仲代达矢 饰）遭人追杀，刺客正是孙兵卫当年的好友带刀所派，继而得知，村民消失事件将要再次发生。这背后究竟隐藏着什么样的秘密？
