Miyako Shin本应成为新宿区政府的一名普通公务员，却被派往东京23个区的所有区都不知道的“夜间地区交流部”工作。这项工作涉及解决由各种怪物引起的超自然事件。
某日，野原新之助（矢岛晶子 配音）正在公园里和风间（真柴摩利 配音）、妮妮（林玉绪 配音）等朋友们玩耍，意外遇见了一位名为金有久美子（钉宫理惠 配音）的神秘女子，久美子告诉小新，自己来自于遥远的未来世界，而彼时已经长大成人的新之助，正是自己的未婚夫。 跟随着久美子，小新一行人来到了未来，在那里，金友电机的社长，亦是久美子的父亲金有增藏手握大权，并且绑架了一直和自己作对的新之助。得知小新的到来会阻碍自己的计划，增藏派出了刺客，在强大的敌人面前，小新能否顺利救出新之助，并且帮助面前这个陷入了黑暗之中的世界重新找回光明呢？
稻叶搬进了一间名为守庄的公寓，他没有想到的是，这不是一间普通的公寓，而是一间怪物和人类混合在一起的怪物公寓。稻叶的房东是一个看起来像黑企鹅的怪物。克服了最初的恐惧，稻叶开始与怪物们生活在一起。随着时间的推移，稻叶发现这些长相奇怪的怪物实际上拥有一颗善良的心。他们的出现逐渐治愈了水稻叶子心中的伤疤。
