三年前太空飞船猎户号坠毁学园都市，由此引发了严重的惨剧，而该事件也促成宇宙电梯恩底弥翁（Endymion）的建设。在恩底弥翁接近完工的前夕，上条当麻（阿部敦 配音）和茵蒂克丝（井口裕香 配音）揭示了热爱歌唱的少女鸣护亚丽莎。两年前，加贺光一郎（安倍昭惠饰演）还是多摩警察局的一名刑事官员。此时，他的父亲（山崎聪饰）病重住院，但加贺从未来访，父子之间的隔阂很难打破。就在这一天，Gaga管辖区发生了一起凶杀案。年仅6岁的女孩井上春太在附近的一个居民区被一名初中生杀害。
