25岁时,一个仍然无所事事的年轻人,安维尔·良介(妻子和丈夫木崎饰)意外欠下了300万日元的债务,之后他被迫成为山冈佑治(松由康子饰)经营的货运公司的职员。虽然日薪高达5万日元,但运输的货物都是尸体等高风险“物品”。
Wille指示Akira(由Yuko Miyamura配音)和Shinri(由Masayama Sakamoto配音)夺回被封在卫星轨道上的Choku飞船和Hina Shinji(由Keimei Ogata配音),但Shinji被绝对禁止登上Choku飞船。无知的真嗣感受到了周围的敌意,跟随Ayanami(由Hyumi Lin配音)登上了突然入侵的9号航班,回到了千疮百孔的NERV总部。在这里,他意外地与朝思叶心目中的Ayanami重聚。他还从父亲那里得知,他将与漂亮的年轻人石田正久一起驾驶第13架飞机。时隔14年,其间的沧桑和情感纠葛让真嗣不知所措。看似温和的长崎为他揭示了各种不可思议的真相。。。这部电影是长荣新剧场版三部曲的第三部。
珍司曾经是一位著名的小说家,但他中途放弃了小说事业。巧合的是,北泽尚曾经是真嗣的粉丝。这场命运般的邂逅,让北泽尚逐渐意识到,自己所拥有的并不是自己想要的。她果断地取消了与男友的订婚,转而热情追求与她地位相去甚远的甄斯。与此同时,北泽被诊断出患有阿尔茨海默病,这也意味着留给她和源氏的时间越来越少。