《来自新世界》改编自桂智友的科幻小说。1000年后,在日本,儿童继续消失,只有想象中的可怕动物与人类进行致命的战争。反乌托邦的未来超级社会“新世界”是一个讲真话的人类可以在“诅咒力量”的帮助下移动物体的世界与智力相当于普通人类的生物共存,被称为“恶魔老鼠”“。乍一看,一切似乎都很平静,但‘新世界’中孩子们的行为被完全控制和约束,不恰当的记忆被抹去,被认为有问题的孩子被当作坏产品单独对待。获得被称为“诅咒力”的特殊能力的人在“八大基本符号”的范围内形成了一个小团体”,无论是在思想上还是在对外界的理解中,记忆、爱情,甚至对生活的控制都被支配着。其中,五个年轻女孩,都早寺、朝比奈、秋月新里也、伊藤守和青沼顺,为了保护日益脆弱的世界和同伴,投入了各种冒险之旅
故事设定在一个身怀魔力的人类濒临灭绝的世界,武力的最高境界从使用利剑,转而到使用魔法,继而变成了使用枪械。就读于培训用以取缔残存魔力威胁的“异端审问官”专业机关——“对魔导学园”的男主角草薙哮,是个完全不会使用枪械,只靠一柄刀与敌人交锋的另类。而他率领的第35试验小队又被称为“杂鱼小队”,顾名思义是由一群劣等生拼凑而成的团队。某一天,拥有“魔女猎人”资格的超精英持枪高手凤樱花,竟然加入了这支队伍。在带领队员动身执行回收魔导遗产的任务中,一场学园动作奇幻大作就此开始。
岛田学校的大规模暴行彻底粉碎了人类与寄生动物共存的观念。泉新一(井上大辅饰演)的生活发生了重大变化,他和柳美(桥本爱饰演)似乎也因这一事件而疏远。