司馬博士殺される原因となったのは、彼が発掘した銅鐸が、敵の古代帝国である邪魔台国の重要な秘密を握っていたためだ。それが今、司馬宙の体内に埋め込まれている。その銅鐸を奪うために、古代よりの侵略者、女王ヒミカとその配下たちが操るハニワ幻人が襲来する。卯月美和の乗るビッグシューターから射出されるジーグのパーツと、頭部に変形する宙が合体、鋼鉄ジーグとなって磁力を駆使した戦闘用オプションパーツを使いハニワ幻人を倒し、ヒミカの野望を打ち砕く!
她的念头似乎触怒了专横的榭尔,因此惹来杀身之祸。危急之时,芭洛特得到犯罪搜查官乌夫库克博士(八岛智人 配音)的救助,并在马杜克紧急法令09的庇护和允许下,拥有了法令禁止的特殊能力。乌夫库克希望借助少女之手,揭露榭尔一系列的罪行。对她来说,这不啻为一次凶险的旅程…… 本片根据冲方丁的科幻小说改编,为“壳中少女”三部曲中的第一部(另两部分别为“燃烧”和“排气”)。