涩谷的中心部跳跃到了300多年以后的“未来”。等在那里的是广袤无边的荒野与森林、散布各处的废墟……以及未来人“revisions”和他们所操纵的巨大机械怪物。 不明原因地遭到怪物蹂躏的涩谷，如同前来拯救它一般而现身的是，与绑架事件中大介的恩人同名且相貌一模一样的少女·米洛。她为大介等人提供了只有他们能够操纵的人形兵器“提线木偶”，并要求他们守护涩谷。 绑架事件的恩人——米洛的预言“守护同伴的命运”，深信着此事活下去的大介，为终将到访的危机以及获得的力量而欢喜。但，5名儿时好友的牵绊由于绑架事件的影响，而变得四分五裂。 孤立的城市。未知的敌人。未确定的过去与命运的预言。少年少女们，为了取回“现在”而与“未来”战斗。一定要回到原本的时代——
前作《A Kite》的故事结束几年之后，宇宙空间站中，各位队员边吃着宇宙食品边抱怨食品的难吃，宇航员野口折外也是其中的一员。过几天是他女儿野口百合花的生日，他托付营养员土井光一将礼物寄送给女儿。
城田真昼（寺岛拓笃 配音）是一位平凡的十五岁少年，个性和善又正义感满满的他是朋友们眼中绝对的正派人物。某日，真昼在回家的路上遇见了一只无家可归的流浪猫，他收留了小猫，给它取名为小黑（梶裕贵 配音），哪知道这个举动使真昼被卷入了一场纠葛于吸血鬼和人类之间的百年争斗之中。 在误打误撞之中，真昼和小黑签订了契约成为了小黑的主人，紧接着，小黑的吸血鬼真祖兄弟们接二连三的出现在他的身边。外表年幼内里老成的阿休（村濑步 配音）、不可一世傲娇毒舌的有栖院御园（下野紘 配音）、疯狂偏激的HYDE（木村良平 配音）、粗暴武断的利希特（岛崎信长 配音），他们的汇聚推动着历史的车轮向前驶去。
