电影版《新世纪福音战士》的第一部。它分为两部分：“死亡”和“重生”。“死亡篇”是根据动画电视原版第1集至第24集的内容改编的，其中一个总结章节经过了重新编辑。
然而，和平却没能一直持续下去，雫丘的上空突然出现了谜样的时空城，以及呼喊着“封印所有奥特曼”的超时空魔神艾塔鲁伽和女战士阿蕾娜（小宫有纱饰）。银河和维克特利同UPG一起与艾塔鲁伽、阿蕾娜展开了战斗，但却遭遇了苦战。 战斗中，从别的宇宙赶来的青年春野武藏（杉浦太阳饰）和赛罗奥特曼出现了。为了打倒艾塔鲁伽，赛罗给光、胜（宇治清高饰）进行了特训。UPG也为了解救被封印的奥特曼，和武藏一起突入进了时空城…
