一个名叫傅纪永(福山润配音)的年轻人成功地进入了高中,他在初中时是暗黑系的一名二级疾病患者。他自称是黑色炎症的大师,自我感觉良好,过着毫无意义的高中生活。
又是一年暑假到来,胖虎(木村昴 配音)和小夫(关智一 配音)怂恿大雄(大原惠 配音),让他拜托哆啦A梦(水田山葵 配音)去寻找尚未被人类开发的秘境。
“新生篇章”的内容延续自第24集的内容:在第17使徒被消灭后,SEELE向NERV发出命令,要求EVA第一架飞机负责执行“人类完成计划”。然而,秀吉并不同意SEELE的做法,并拒绝执行。SEELE认定这是一种反叛行为,并决定彻底消灭NERV。黎明时分,NERV总部突然遭到战略自卫队的袭击,他们对NERV人员进行了残酷的屠杀。为了保护司机,葛成美利下令将精神崩溃的阿基拉送上第二架飞机,并将其安置在湖底深处。他亲自去营救日久真嗣。但在这一点上,Ikashi Shinji已经处于精神崩溃的边缘。