〈禁書館〉を拠点に、魔法薬の研究者として名をはせたセービル。 魔法薬は世界に広まり、誰もが気楽に魔法を使える時代が訪れた。 そんなセービルにある日ロスが知らせた、違法な魔法薬の存在。
ある日学院の行事である竜によるレースの最中、他国のスパイに遭遇したアッシュは彼らを退けたものの、崖下へと転落してしまう。その時、アッシュの左腕に刻まれた星刻が輝き、そこから幼竜が誕生したことで生き延びる。しかし生まれた竜は何故か人間の少女の姿をしていて、目覚めた途端に「あたしがあんたの飼い主なのよ!」とアッシュに対して逆飼い主宣言をしてしまう。 かくして「あらゆる竜を乗りこなす男」アッシュ・ブレイクは、唯一乗りこなせない相棒エーコと共に波乱の学院生活を送り始めるのだった。