经过一番激战,泽塔奥特曼独自一人追着怪兽前往地球。 在地球上,人们为了对抗日常出现的怪兽组成了防卫军——怪兽应对机甲部队“军械库(storage)”。在这支部队中有一位热血青年——夏川春树。 宇宙怪兽到达地球的那一刻,泽塔奥特曼和春树相遇了。自此两位热血青年的战斗故事开始了 。
一护再次拿起屠魂之刃,踏上战场。另一方面,在尸魂境界中观察到,当前世界的空虚突然而持续地消失了。灵魂被引导到这片土地的流魂街的居民消失了,死神驻扎的灵屋景灵亭也遭到了土匪的袭击。土匪军队的真实身份是由消灭师创始人尤哈巴领导的“隐形帝国”。看不见的帝国向死神宣战。五天后,尸魂界被“看不见的帝国”毁灭,死神背负了数千年的命运。命运和隐藏的真相终于揭晓了。一切都快结束了。黑崎一护,最后的战斗已经开始--
以受到网络犯罪威胁的现代日本为舞台,将江户川作品中的角色“怪人二十张脸”改编成一个国际黑客组织。