Nakamura Kotaro（由Yoichi Nakamura配音）是一名看似普通的高中生，在价格极其实惠的考拉别墅公寓106室过着平静的生活。小太郎再也没有想到的是，有一天，他平静的生活会因为一个年轻女孩的出现而彻底改变。
少女为了保护悠二不被法利亚格尼袭击，开始与悠二一同生活。悠二满怀感激向少女道谢，不料少女却如此低喃：“你已经不存在了。” 我已经死了？存在丧失者·悠二为何还能够思考呢……
在私立莉莉安女子学院，有这样一个制度，新生应该选择一个学长，两人将成为“姐妹”。在学校学习期间，姐姐会照顾并教授姐姐各方面的生活礼仪。在学院里，山百合协会的名字如雷，作为校长，小笠原和子（伊藤美由纪配音）、黑口理子（森田名美配音）和佐藤佐加（Masamuchi Keimei配音）是学院女孩们羡慕的对象。他们被称为学院的三朵玫瑰，在工作日，他们和他们的妹妹，也被称为玫瑰花蕾，负责管理学生会的规模问题。平凡的少女Fuzawa Yousi（吉田佳奈配音）阴差阳错地成为了祥子的玫瑰花蕾，同时也肩负着管理山百合俱乐部的责任。在与其他花蕾相处的过程中，一种温暖而轻松的校园生活开始了。
