在一列从东京开往大阪的特快列车上,坐着一位尊贵而特殊的客人。她是来自欧洲英格拉姆帝国女王莎莉贝丝,随行的还有其年幼的儿子菲利浦王子。女王拥有一颗欧洲最大的宝石——水晶之母,这也引起了怪盗基德的注意。
长期以来,联邦调查局副局长卡特(西德尼·波蒂埃饰)和俄罗斯情报官员瓦伦蒂娜(戴安·韦诺拉饰)一直在追捕一名非常危险的罪犯。他拥有高度致命的化学武器,精通计算机和变装,狡猾而残忍,是对世界和平的主要威胁。
《创圣大天使LOGOS》讲述由于SNS的普及,现代的无意义文字正在增加。在文字的世界LOGOS WORLD,发生了影响到现实世界的异常事态。灰吹阳等创声部的成员为了解开文字中隐含的意义,直面世界的危机。