战争结束后,这些破坏性武器的下落成为需要解决的首要问题,所有人都同意将其委托给监护人保管。丹恒(平川大辅配音)和丹飞(中原麻衣配音)这对兄弟姐妹作为护印人,承担了保管最强武器“天谴剑”的责任,但也给他们两人造成了致命的灾难。最终,天行剑还是落入了米天健(关志毅配音)的手中。为了取回魔剑,丹飞踏上了一段旅程,在旅途中他遇到了两个人,林雪雅(鸟广司配音)和尚不言(水洼顺义配音)。
作为庆祝“宠物精灵”系列25周年的纪念活动之一,神奇宝贝公司将于2021 9月9日起推出一系列新的动画作品“宠物精灵的进化”。故事舞台将横跨神奇宝贝世界的八个已知区域,讲述八名玩家的故事,他们熟悉不同信仰和欲望的人。