故事开始于16世纪的佛罗伦萨。阿尔蒂（小松武子配音）是一个出生在贵族家庭的年轻女孩。她性格外向，对世界充满好奇。从很小的时候起，阿尔蒂就深深地沉迷于绘画，并立志成为一名画家。然而，在那个时代，一个女人想要成为一名画家是完全不可能的。【異形特攻學園】描述距離現今不遠的未來世界裡，到處都可以看到異星人，人們一點也不覺得稀奇，即使在小學裡…在小學裡每個人都會被分配到不同的工作，像是生活股長、衛生股長、飼育股長，當然也有叫作「異形應變小組」的工作 。
