高中生角田优(西岛隆宏 饰)自幼丧母,多年来他和身为神父的父亲角田哲(渡部笃郎饰)相互依靠,过着平淡的生活。但熏(渡边真起子 饰)到来打破了一切,她来去匆匆,敢爱敢恨,令角田哲癫狂不已,更将怨气全部撒在优的身上,强迫儿子每天忏悔认罪。
一日,海人马琳(阿澄佳奈 配音)在海底捡到了一枚戒指,为了将它归还给失主,她和妹妹乌琳(堀江由衣 配音)来到陆地上,开始了一场大冒险。马琳顺利找到了戒指的主人宫守夏音(寿美菜子 配音),可是由于夏音的任性,戒指再度丢失。在寻找戒指的途中,马琳意外的打开了装载着邪恶力量的石棺,世界陷入了危机之中。与此同时,栖息在马琳和夏音体内的巫女力量也开始觉醒,作为“海之巫女”和“空之巫女”,女孩们能够战胜凶恶的幽灵吗?