耗日持久的战争结束了,大地虽然满目疮痍,但总算迎来了短暂的平静,一片苍白的静默之中,地球进入了“衰退期”,历史的车轮倒转,整个世界停摆了。童年时代,深空彼方(金元寿子 配音)曾在一片废墟之中邂逅了一位神秘的女子,女子用手中的小号吹奏了《奇异恩典》,被美妙音乐吸引的彼方开始对小号发生了兴趣。 长大后,彼方加入了军队,被编入1121小队,在那里,她成为了一名通信兵。外表刚强内心柔软的和宫梨旺(小林优 配音)、个性傲娇不会轻易低头的墨埜谷暮羽(喜多村英梨 配音)、冷漠的天才少女寒凪乃绘留(悠木碧 配音)、成熟稳重的费利西娅(远藤绫 配音),在军中,彼方结识了这些个性迥异的好友,充满了快乐的日常就此展开。
在他们过夜的那天晚上,野原一家遭到了一个神秘的忍者团体的袭击。辛志洙被绑架了。爱祖隐家是忍者的故乡,一个世代守护地球能量的家族,被称为“宁特鲁”。因此,地球的生存交给了忍耐方法的新帮助。
岛田学校的大规模暴行彻底粉碎了人类与寄生动物共存的观念。泉新一(井上大辅饰演)的生活发生了重大变化,他和柳美(桥本爱饰演)似乎也因这一事件而疏远。