让光希没有想到的是，即将成为自己的义兄的阿游（吉沢亮 饰）竟然和自己在一个学校念书。 阿游是一个拥有英俊外貌和强大能力的男孩，只是对于光希来说，阿游的个性有些恶劣，总是喜欢捉弄自己。在和阿游开始了“同居生活”后，自己的好友银太（佐藤大树 饰）突然性情大变，还强吻了光希，这让光希一下子陷入了混乱之中。
为了同这股势力抗争，一群名为“舰娘”的女孩子们出现了，在她们的体内，栖息着舰艇之魂，亦是明日呢化身成为各式各样的战舰，为了人类的和平做着不懈的努力。 平日里，舰娘们在名为“镇守府”的大本营里进行日常生活和训练，某日，一位名叫吹雪（上坂堇 配音）的活泼女孩出现在了大家的面前，初来乍到的她踌躇满志，热情满满地加入了舰队的新生活中去，在这里，充满了精彩和刺激的日常就此展开。
受到突如其来的怪兽袭击，地球上的人类几乎灭亡。为了人类最后的希望，由7名女性组成的TEAM·U守护着地球上最后的孩子。 与此同时，因为听到呼唤而从其它宇宙前来的赛罗奥特曼、戴拿奥特曼和高斯奥特曼成功与TEAM·U会合。
