鸣人从小就孤独无助。十多年过去了,年轻的鸣人被木叶村的忍者学校录取,在那里他遇到了好朋友佐助和小樱。佐助是宇智波家族的继承人之一。当他还是个孩子的时候,他的兄弟,一个已经拥有高超忍术的忍者,杀死了他们家的所有人,然后投奔了大蛇丸,大蛇丸一直想摧毁木叶村。佐助从小就发誓要超越他的兄弟,为这个家族报仇。火影忍者和他们的团队在忍者学校接受了教官卡卡西的精心指导,在他的帮助下,他们在成长过程中一次又一次地面临挑战!
最初,这个女孩的名字叫中原岬(由牧野裕一配音),她自称是“日本刮柴协会”的成员。她此行的目的是帮助佐藤恢复健康,脱离废木的行列。一直住在隔壁的动漫美女近山崎隆(由坂口大藏配音)也是该协会的成员吗?进入协会的主要任务是创建H游戏?坚持帮助自己的中原,是不是也是一块只有帮助别人才能找到存在感的无用之木?许多事件的发生逐渐让佐藤怀疑,这种所谓的关联很可能是一场阴谋。