拥有美丽外表但性格孤僻的大小姐榊由美子(田中凉子 配 音)、个性开朗活泼,稍稍有些男孩子气的周防天音(田口宏子 配音)、倔强傲娇运气极差的松岛满(水桥香织 配音)、外表天真可爱实则有着悲惨过去的入巢莳菜(民安智惠 配音)和尽忠职守的天然呆小岭幸(清水爱 配音),五个表面看来天真烂漫的女孩,各自却有着灰暗的过去,雄二的到来能否扫清她们心中的阴霾?
中学理科老师矢的猛(长谷川初范 饰)是一名心中充满了正义感和责任感的有志之士,对于曾经四处作恶搅得人心惶惶的怪兽,矢的猛深信其实是来自于人类的负能量造就了它们,因此,作为一名老师,矢的猛一直都致力于教导学生们什么是正义,什么是邪恶。
在这紧要关头,人类组成宇宙舰队远征火星,结果几乎全军覆没,侥幸逃回的大和号成为人类最后的希望。与此同时,一个神秘装置穿越万里银河坠落地球,经检测发现该装置竟然能消除放射性物质。为了从装置的主人——麦哲伦星云伊斯坎达尔星的高智慧生物那里寻求帮助,人类决定孤注一掷,派遣大和号进行这次远征。火星之战中失去哥哥的原宇宙舰队成员古代进(木村拓哉 饰)应召归队,和一众好友成为了见证伟大历史时刻的一员。而得知人类动向的加米拉斯也发起了一波波的致命攻击…… 本片根据松本零士的同名原著改编。