无法在这个世界使用炼金术的爱德华,与长相酷似弟弟的青年爱尔凡斯一起研究火箭的科技,希望借助火箭回到原来的世界。另一边的炼金术世界,弟弟阿尔冯斯修行炼金术,打扮宛若曾经的爱德华,与国家炼金术士们一起寻找找回哥哥的方法。 而暗地中,慕尼黑的一个神秘组织开始了寻找理想国“香巴拉”的仪式,连接炼金术世界与现实世界的“门”被打开了。 兄弟二人的命运与两个世界的危机交织在一起,爱力克兄弟要面对前所未有的挑战。
与此同时,石川学会会长伊田秀吉(一川春树饰演)高调参政,暗中向包括小泽在内的一批年轻政客发出信号,策划恐怖袭击,以此为契机点燃王朝变革的革命浪潮。绪方希望井上参与,但被对方拒绝,因此井上成为了伊达走向王位的绊脚石。。。这部电影是同名电视剧(另一部是《革命》)的电影版,并在2011年获得第34届日本电影学院奖主题奖。