左翔太郎(桐山漣 饰)和飞利浦(菅田将暉 饰)合体变身为假面骑士W,风都警署警官照井龙(木ノ本嶺浩 饰)则化身假面骑士阿克塞尔,与入侵的Dopont进行殊死搏斗。在国际特务调查机关员玛丽亚•S•克兰贝蒂(杉本彩 饰)的协助下,正义战士们击退了入侵者,却发现他们原本都是佩戴了盖亚记忆体的普通市民。从玛丽亚的口中得知,国际重犯大道克己(松岡充 饰)及其邪恶组织“Never”的成员们劫持了编号A~Z的26个盖亚记忆体,他们更阴谋占领风都。 一场激烈的正邪战争即将展开……
2010年,前小学生已经进入大学,太一、阿和等人走上了不同的人生道路(八神太一和石田大和将长大到22岁)。此时此刻,数字宝藏的研究人员Koji(松冈莫约配音)告诉他们,随着“被选中的孩子”长大,数字宝藏也会消失。