作品描述身为班长(委员长)、并且拥有完美主义的主角「北神未海」,虽然暗恋着问题三人组之一的「东条潮」,却因为不断有人搅乱导致她至今无法告白。未海因为自己的事情搞的手忙脚乱,另一方面还要帮助其他人解决烦恼、并给他们完美的建议,《極上!!めちゃモテ委員長》就是描绘这些发生在主角周围大小事的高中校园作品。
武田面临再次入狱,将会长职务传给新生代松村保(北大路欣也 饰),元老人物大友胜利(穴户锭 饰)和早川英男(织本顺吉 饰)对武田一派摒弃极道的生活方式不以为然,联合广能的兄弟市冈辉吉(松方弘树 饰)谋取天政会统治权,但市冈遇刺,大友一派落败。 对腥风血雨感到厌倦的武田萌生退意,亦劝广能(菅原文太 饰)退出,但为市冈报仇心切的广能怎可罢休?另一方面,大友组复仇击杀天政会副理事长江田省一(山城新伍 饰),松村亦受重伤。伤重的松村念念不忘和平统一广岛的梦想……