三元火山的爆发唤醒了沉睡的哥斯拉。为了补充能量，它先后攻击了一艘日本渔船和一艘苏联潜艇。日本政府反对使用核武器，因为这会导致无辜公民伤亡。因此，他们派出了超级消防战士与哥斯拉正面作战。与此同时，林天博士还发现哥斯拉会受到一种无线电波的影响，并会带着它回家。因此，计划让哥斯拉随着无线电波落入火山口，消灭哥斯拉。
